Rheumatoid Arthritis
 
Rheumatoid Arthritis

rs6457617
 Genotype  Effect
   CC    normal
   CT    2.3x risk of rheumatoid arthritis
   TT    5.2x risk of rheumatoid arthritis
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
 
rs7528684
 Genotype  Effect
   AA    normal
   AG    normal
   GG    1.2x risk
Ann Rheum Dis. 2006 May;65(5):671-3. 
Ann Rheum Dis. 2007 Jun;66(6):803-6. 
J Neuroimmunol. 2008 Mar;195(1-2):146-50. 
Nat Genet. 2005 May;37(5):478-85. 
J Hum Genet. 2008;53(2):163-73. 
J Dermatol Sci. 2008 Nov;52(2):118-22. 
 
rs1748035
 Genotype  Effect
   AA    ?
   AG    ?
   GG    ?
Nat Genet. 2003 Aug;34(4):395-402. 
Rheumatol Int. 2007 Jul;27(9):827-33. 
 
rs11203367
 Genotype  Effect
   CC    ?
   CT    ?
   TT    ?
Nat Genet. 2003 Aug;34(4):395-402. 
Rheumatol Int. 2007 Jul;27(9):827-33. 
 
rs3087243
 Genotype  Effect
   AA    average
   AG    increased risk for auto-immune diseases
   GG    increased risk for auto-immune diseases
J Clin Endocrinol Metab. 2006 Mar;91(3):1087-92. 
Am J Hum Genet. 2005 Dec;77(6):1044-60. 
Arthritis Rheum. 2004 Jul;50(7):2211-5. 
Transpl Immunol. 2008 Jan;18(3):246-9. 
 
rs615672
 Genotype  Effect
   CC    ?
   CG    ?
   GG    ?
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
 
rs7026551
 Genotype  Effect
   AA    ?
   AC    ?
   CC    ?
N Engl J Med. 2007 Sep 20;357(12):1199-209. 
 
rs743777
 Genotype  Effect
   AA    normal
   AG    1.1x risk
   GG    1.7x risk
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
 
rs6684865
 Genotype  Effect
   AA    normal
   AG    1.2x risk
   GG    1.5x risk
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
 
rs2240335
 Genotype  Effect
   TT    ?
   GT    ?
   GG    ?
Nat Genet. 2003 Aug;34(4):395-402. 
 
rs10733648
 Genotype  Effect
   CC    ?
   CT    ?
   TT    ?
N Engl J Med. 2007 Sep 20;357(12):1199-209. 
 
rs1930780
 Genotype  Effect
   CC    ?
   CG    ?
   GG    ?
PLoS Med. 2007 Sep;4(9):e278. 
 
rs2416804
 Genotype  Effect
   CC    ?
   CG    ?
   GG    ?
PLoS Med. 2007 Sep;4(9):e278. 
 
rs3761847
 Genotype  Effect
   AA    normal
   AG    1.3x risk
   GG    >1.3x risk
N Engl J Med. 2007 Sep 20;357(12):1199-209. 
 
rs10818488
 Genotype  Effect
   AA    2.1x increased risk for rheumatoid arthritis
   AG    1.4x increased risk for rheumatoid arthritis
   GG    normal
Hum Immunol. 2008 Sep;69(9):567-71. 
Arthritis Rheum. 2008 Sep;58(9):2670-4. 
Ann Rheum Dis. 2008 Nov;67(11):1578-80. 
 
rs2104286
 Genotype  Effect
   AA    1.7x risk for RA; 1.6X for T1D; also MS?
   AG    1.4x risk for RA; 1.3x for T1D; also MS?
   GG    normal
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
 
rs3765598
 Genotype  Effect
   CC    ?
   CT    ?
   TT    ?
Am J Hum Genet. 2005 Oct;77(4):567-81. 
 
rs11162922
 Genotype  Effect
   AA    2x risk
   AG    1.3x risk
   GG    normal
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
 
rs2070744
 Genotype  Effect
   CC    increased prostate cancer risk
   CT   
   TT    increased cardiovascular risk
Arthritis Rheum. 2006 Oct;54(10):3144-51. 
J Am Coll Cardiol. 2006 Sep 19;48(6):1166-74. 
BMC Cancer. 2008 Sep 29;8:273. 
 
rs11761231
 Genotype  Effect
   CC    1.6x risk
   CT    1.4x risk
   TT    normal
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
 
rs3816587
 Genotype  Effect
   CC    1.3x risk
   CT    normal
   TT    normal
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
 
rs6920220
 Genotype  Effect
   AA    1.7x risk
   AG    1.2x risk
   GG    normal
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
 
rs6679677
 Genotype  Effect
   AA    5.2x risk for T1D; 3.3x for RA
   AC    1.8x risk for T1D; 2x risk for RA
   CC    normal
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
Diabetes. 2008 Jun;57(6):1730-7. 
 
rs9550642
 Genotype  Effect
   AA    2.2x risk
   AG    1.3x risk
   GG    normal
Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. 
 
rs10985112
 Genotype  Effect
   AA    ?
   AG    ?
   GG    ?
PLoS Med. 2007 Sep;4(9):e278.